ตลาดนัดบ้านกูบู ได้เกิดขึ้นเมื่อปี 2536 โดยบุคคลนอกพื้นที่ ที่เล็งเห็นว่า บ้านกูบู มีประชาชนอยู่กันเป็นชุมชน ซึ่งส่วนใหญ่เป็นคนพื้นที่ดั้งเดิม บ้านกูบูมีชายหาดที่สวยงามบรรยากาศดี สงบ ร่มรื่น  ทำให้ชาวบ้านในพื้นที่และพื้นที่ใกล้เคียงนิยมมาพักผ่อน
          นายแบแว ไม่ทราบนามสกุลเชื้อสายปากีสถาน  ซึ่งเป็นคนตำบลศาลาใหม่ อำเภอตากใบ จังหวัดนราธิวาส  มีอาชีพขายผ้าโสร่ง มักจะมาขายผ้าให้กับชาวบ้านตำบลศาลาใหม่ และตำบลใกล้เคียง โดยเฉพาะบ้านกูบู เพราะมีความสนิทกับชาวบ้านในละแวกนั้น นายแบแวจึงมีแนวคิดที่จะสร้างตลาดนัดที่ชายหาดบ้านกูบู เพราะเห็นว่าเป็นสถานที่ๆ เหมาะสำหรับเป็นแหล่งซื้อขายสินค้าได้ เมื่อมาซื้อของแล้วก็สามารถชมบรรยากาศของชายหาดบ้านกูบูที่มีความเป็นธรรมชาติและสวยงาม ทั้งเป็นการสร้างอาชีพให้กับคนในชุมชนได้นำผลผลิตของตนเองมาแลกเปลี่ยนซื้อขายกัน จึงได้ปรึกษากับกำนันตำบลไพรวัน ในขณะนั้นคือนายนิสิต โว๊ะนิเน็ง
          นายนิสิต โว๊ะนิเน็ง กำนันตำบลไพรวัน เห็นด้วยกับแนวคิดของนายแบแวที่จะสร้างตลาดนัดที่บ้านกูบู ท่านก็เลยชักชวน ผู้สนใจในหมู่บ้านมาเป็นหุ้นส่วนรวมทุนสร้างตลาดนัด ซึ่งในตอนนั้นมีผู้สนใจร่วมเป็นสมาชิกทั้งหมด 16 คน เก็บค่าหุ้นคนละ 500.-บาท ได้เงิน 8,000.-บาท ก็เริ่มสร้างเพิงขายของบนที่ดินของพี่ชายกำนันคือ นายนิมะ โว๊ะนิเน็ง โดยสร้างจากไม้เสม็ดที่หาได้ในพื้นที่และมุงหลังคาสังกะสี แรกๆ มีเพียงสมาชิกไม่กี่ร้านที่นำสินค้ามาขาย และเริ่มดีขึ้นเป็นลำดับจนเพิ่งที่ทำไว้ไม่เพียงพอ พ่อค้าแม่ค้าที่มาทีหลังต้องหาที่ขายกันเองปัจจุบันผู้ก่อตั้งตลาด ทั้ง 3 ท่าน คือท่านแบแว ท่านกำนันนิสิต และเจ้าของตลาด คือ ท่านนิมะ โว๊ะนิเน็ง ได้เสียชีวิตหมดแล้ว แต่ตลาดนัดกูบูยังคงดำเนินการอยู่โดยบุตรของท่านนิมะ โว๊ะนิเน็ง คือ นางสาวนิสากร โว๊ะนิเน็ง เป็นเจ้าของตลาด
          ปัจจุบัน ตลาดนัดบ้านกูบู มีเฉพาะวันอาทิตย์ และวันพฤหัสบดี ตั้งแต่เวลา 07.00 – 12.00 น. โดยประมาณ มีแม่ค้าประมาณ 40 - 50 ราย บ้านกูบูไม่เพียงแต่มีตลาดนัดเท่านั้น ใกล้ๆ กัน ยังมีแหล่งทำมาค้าขายอีกแห่งหนึ่งนั้นก็คือวิสาหกิจชุมชนศูนย์อาชีพ ซึ่งเป็นการรวมตัวกันของชาวบ้านในแต่ละแวกนั้น ผลิตสินค้าจากผ้าบาติก ซึ่งได้รับความนิยมจากคนในพื้นที่จังหวัดนราธิวาสและจังหวัดใกล้เคียงด้วย